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環境省では、瀬戸内海の底質と底生生物の概況について調査するため、「瀬戸内海環境情報基本調査」をこれまで４回実施してきた（第１回（昭和56～60年度）、第２回（平成３～６年度）、第３回（平成13～16年度）、第４回（平成27～29年度））。平成27～29年度に測定した瀬戸内海における底質（含泥率、化学的酸素要求量、強熱減量、全燐、全窒素、酸化還元電位）の分布状況と底生生物の分布状況（マクロベントス個体数、マクロベントス種類数）を示す。また、４回目の調査で、以下のように考察されている。
(1)底質
含泥率が低い海域（＜10％）は豊後水道、伊予灘、安芸灘、備讃瀬戸、播磨灘東部であった。一方、大阪湾、播磨灘、備後灘、燧灘、広島湾、周防灘では含泥率が80％を越えていた海域がほとんどであった。
(2)底生生物
個体数は備後水道、伊予灘、安芸灘、備讃瀬戸や播磨灘の明石・鳴門海峡付近で高い傾向を示し、種類もこれらの海域で高かった。一方、大阪湾、播磨灘、備後灘、燧灘、広島湾や周防灘では個体数、種類数ともに低かったが、第２～４回調査間で上昇傾向であった。
第３回底質分布図
底質分布図（含泥率）
単位：％
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
底質分布図（COD）
単位：mg/g
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
底質分布図（強熱減量）
単位：％
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
底質分布図（全燐）
単位：mg/g
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
底質分布図（全窒素）
単位：mg/g
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
底質分布図（酸化還元電位）
単位：mV
注）環境省「瀬戸内海環境情報基本調査」（平成13年～16年）による。
第３回底生生物、 第４回底質、 第４回底生生物 の分布状況はこちら
