日本の条約湿地
各条約湿地の概要
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クッチャロ湖（くっちゃろこ）
- 所在地：
- 北海道 浜頓別町
- 登録年月日：
- 1989.7.6
- 面積（ha）：
- 1,607
- 湿地の特徴：
- 大規模ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定浜頓別クッチャロ湖鳥獣保護区浜頓別クッチャロ湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の北部に位置。周囲30km、海岸砂丘地で海と隔てられたオホーツク海岸線最大の海跡湖。冬期、シベリアから南下するハクチョウ類、ガンカモ類の最初の中継地。特に、日本で越冬するほとんどのコハクチョウ（約6千羽）がこの湖を経由。
サロベツ原野（さろべつげんや）
- 所在地：
- 北海道 豊富町・幌延町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 2,560
- 湿地の特徴：
- 高層・中層・低層湿原、オオヒシクイ、コハクチョウ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定サロベツ鳥獣保護区サロベツ特別保護地区
利尻礼文サロベツ国立公園特別保護地区及び特別地域 - 湿地の概要：
- 北海道の北部に位置。泥炭地上に成立した高層湿原、中間湿原、低層湿原及び沼で構成。低地の平野部でよく発達した高層湿原が特徴。ペンケ沼及びパンケ沼周辺は水鳥の繁殖地、特に春秋にはオオヒシクイやコハクチョウなどガンカモ類の重要な渡りの中継地である。
濤沸湖（とうふつこ）
- 所在地：
- 北海道 網走市・小清水町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 900
- 湿地の特徴：
- 低層湿原、湖沼、大規模オオハクチョウ・ヒシクイ等渡来地
- 保護の形態：
- 国指定濤沸湖鳥獣保護区濤沸湖特別保護地区
網走国定公園特別地域 - 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。砂嘴の発達によって形成された海跡湖であり、汽水湖である。藻場や塩性湿地も発達している。また、ガンカモ類、シギ・チドリ類等の有数の渡り鳥の渡来地である。オジロワシ、オオワシの越冬が確認されているほか、タンチョウの繁殖も確認。
雨竜沼湿原（うりゅうぬましつげん）
- 所在地：
- 北海道 雨竜町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 624
- 湿地の特徴：
- 高層湿原
- 保護の形態：
- 暑寒別天売焼尻国定公園特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の中西部に位置。山地型高層湿原としては我が国でも有数の面積規模を誇る。湿原の中央にはペンケペタン川が多数の池塘群と浮島を縫うように蛇行して流れている。水生、湿原性及び高山性の植物群が混交するなど自然性の高い優れた景観を呈している。
野付半島・ 野付湾（のつけはんとう・のつけわん）
- 所在地：
- 北海道 別海町・標津町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 6,053
- 湿地の特徴：
- 塩性湿地、低層湿原、藻場、大規模コクガン・ホオジロガモ等渡来地
- 保護の形態：
- 国指定野付半島・野付湾鳥獣保護区野付半島・野付湾特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。野付半島は根室海峡に突き出た釣ばり状の砂嘴であり、その延長は日本最大で26㎞。野付湾は、野付半島と北海道本土との間に形成されている。湾内の平均水深は４ｍであり、広大な干潟及びアマモ場が形成されている。当該区域は渡り鳥の大規模な渡来地となっている。
阿寒湖（あかんこ）
- 所在地：
- 北海道 釧路市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 1,318
- 湿地の特徴：
- 淡水湖、マリモ生育地
- 保護の形態：
- 阿寒摩周国立公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 北海道の東部の内陸部に位置。火山活動によって形成された広大なカルデラ湖。マリモなど希少な藻類の生育地であり、アジアにおける天然分布の南限となるヒメマスやイトウなどの魚類やカワシンジュガイなど二枚貝類の重要な生息地である。
宮島沼（みやじまぬま）
- 所在地：
- 北海道 美唄市
- 登録年月日：
- 2002.11.18
- 面積（ha）：
- 41
- 湿地の特徴：
- 大規模マガン渡来地
- 保護の形態：
- 国指定宮島沼鳥獣保護区宮島沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の中央部よりやや西方に位置。石狩川の河跡湖沼群の一部。シベリア等北半球の繁殖地を往復するガンカモ類、ハクチョウ類の中継地として国際的に重要。日本で越冬するマガンのほとんどが宮島沼を中継地として利用。
風蓮湖・春国岱（ふうれんこ・しゅんくにたい）
- 所在地：
- 北海道 根室市・別海町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 6,139
- 湿地の特徴：
- 汽水湖、低層湿原、藻場、タンチョウ繁殖地、大規模キアシシギ・オオハクチョウ等渡来地
- 保護の形態：
- 国指定風蓮湖鳥獣保護区風蓮湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。風蓮湖は根室湾につながる汽水湖で干潟とアマモ場が発達。春国岱は、風蓮湖と根室湾の間に形成された砂州であり、アカエゾマツ林やハマナスの大群落が発達。これらの森林、草地、塩性湿地、干潟等は鳥類の良好な生息環境となっており、渡り鳥の渡来及び中継地として重要である。
釧路湿原（くしろしつげん）
- 所在地：
- 北海道 釧路市・釧路町・標茶町・鶴居村
- 登録年月日：
- 1980.6.17
- 面積（ha）：
- 7,863
- 湿地の特徴：
- 低層湿原、タンチョウ生息地
- 保護の形態：
- 国指定釧路湿原鳥獣保護区釧路湿原特別保護地区
釧路湿原国立公園特別保護地区及び特別地域 - 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。湿原の80%はヨシ・スゲ群落とハンノキ林が特徴の低層湿原である。ミズゴケが生育する高層湿原もわずかではあるが分布。カモ類、ハクチョウ類の越冬地、渡りの中継地であり、タンチョウの主な繁殖地でもある。さらにオジロワシ、オオワシ等の大型鳥類も生息。
霧多布湿原（きりたっぷしつげん）
- 所在地：
- 北海道 浜中町
- 登録年月日：
- 1993.6.10
- 面積（ha）：
- 2,504
- 湿地の特徴：
- 高層湿原、タンチョウ繁殖地
- 保護の形態：
- 国指定厚岸・別寒辺牛・霧多布鳥獣保護区厚岸・別寒辺牛・霧多布特別保護地区、厚岸霧多布昆布森国定公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。ミズゴケ泥炭地を基盤とする高層湿原と満潮時に海水が流入する２つの汽水湖から構成される。オオハクチョウ、ヒシクイ等ガンカモ類、ハクチョウ類が多数渡来する。また、タンチョウの繁殖地も分布する。
厚岸湖・別寒辺牛湿原（あっけしこ・べかんべうししつげん）
- 所在地：
- 北海道 厚岸町
- 登録年月日：
- 1993.6.10
- 面積（ha）：
- 5,277
- 湿地の特徴：
- 低層湿原、高層湿原、大規模オオハクチョウ・ガンカモ渡来地、タンチョウ繁殖地
- 保護の形態：
- 国指定厚岸・別寒辺牛・霧多布鳥獣保護区厚岸・別寒辺牛・霧多布特別保護地区、厚岸霧多布昆布森国定公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 北海道の東部に位置。汽水湖である厚岸湖とそれに流入する別寒辺牛川周辺のヨシ・スゲを中心とする低層湿原であり、中央部は部分的に高層湿原。海岸沿いには塩性湿地が発達。タンチョウの繁殖地も分布し、厚岸湖は冬でも全面凍結しないため、オオハクチョウの国内最大級の越冬地である。
ウトナイ湖（うとないこ）
- 所在地：
- 北海道 苫小牧市
- 登録年月日：
- 1991.12.12
- 面積（ha）：
- 510
- 湿地の特徴：
- 大規模ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定ウトナイ湖鳥獣保護区ウトナイ湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 北海道の南西部に位置。周囲9kmの淡水・海跡湖である。湖岸水辺にヨシ、スゲ、マコモ、フトイ等の挺水植物群が分布し、湖岸を落葉広葉樹が占める。渡りの我が国有数の中継地で、ハクチョウ類、ガンカモ類が数千羽飛来し､繁殖する鳥類は270種以上である。
大沼（おおぬま）
- 所在地：
- 北海道 七飯町
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 1,236
- 湿地の特徴：
- 淡水湖、堰止湖群
- 保護の形態：
- 大沼国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 北海道の南西部にある渡島半島の東側に位置している。大沼、小沼、蓴菜沼等の湖で構成され、12月から3月まで全面結氷する。活火山の駒ヶ岳、砂原岳等の山々に囲まれ、多くの溶岩小丘が湖内にある変化に富んだ景観等から、1958年に北海道で最初の国定公園に指定された。
仏沼（ほとけぬま）
- 所在地：
- 青森県 三沢市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 222
- 湿地の特徴：
- オオセッカ繁殖地
- 保護の形態：
- 国指定仏沼鳥獣保護区仏沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 青森県の東部、下北半島の太平洋側に位置する小川原湖と海岸砂丘に挟まれた干拓地。ヨシを優占種とする低層湿原。オオセッカ、コジュリン、オオヨシゴイなど希少な鳥類の繁殖地及び渡来地となっている。また、水鳥等渡り鳥の中継地ともなっている。
伊豆沼・内沼（いずぬま・うちぬま）
- 所在地：
- 宮城県 栗原市・登米市
- 登録年月日：
- 1985.9.13
- 面積（ha）：
- 559
- 湿地の特徴：
- 大規模マガン等ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定伊豆沼鳥獣保護区伊豆沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 宮城県の北部に位置。水深1m、マコモ、ヨシ等の挺水植物群落、ハス、ヒシ、ヒルムシロ等の水生植物が繁茂する淡水湖沼である。マガン、ヒシクイ、マガモ等有数のガンカモ類の越冬地であり、ハクチョウ等多数の野鳥が生息する。
志津川湾（しづがわわん）
- 所在地：
- 宮城県 南三陸町
- 登録年月日：
- 2018.10.18
- 面積（ha）：
- 5,793
- 湿地の特徴：
- 藻場、コクガンの渡来地
- 保護の形態：
- 三陸復興国立公園海域公園地区
- 湿地の概要：
- 志津川湾は太平洋に面する三陸海岸の南部に位置する海洋沿岸域の湿地である。湾内には、アマモ場、コンブ場、アラメ場、ガラモ場という4つのタイプの藻場が良く発達しており、アマモ場には、絶滅危惧種を含むアマモ、スゲアマモ、タチアマモ、スガモの4種が生育する。海草と海藻類以外にも700種以上の海洋生物の餌場や生息地となり、海洋生物の多様性を支えている。また、藻場を餌場とする環境省レッドリストで絶滅危惧Ⅱ類のコクガンに関しては、毎年、100羽以上が飛来し、越冬地になっている。
蕪栗沼・ 周辺水田（かぶくりぬま・しゅうへんすいでん）
- 所在地：
- 宮城県 栗原市・登米市・大崎市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 423
- 湿地の特徴：
- 大規模マガン等ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定蕪栗沼・周辺水田鳥獣保護区蕪栗沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 宮城県の北部に位置する。北上川の支流である旧迫川の氾濫源に形成された自然遊水池の沼及びその周囲の水田地帯である。マガン、オオヒシクイ、オオハクチョウ及びカモ類の越冬地として全国でも最大級の規模を持つ。
化女沼（けじょぬま）
- 所在地：
- 宮城県 大崎市
- 登録年月日：
- 2008.10.30
- 面積（ha）：
- 34
- 湿地の特徴：
- ダム湖、ヒシクイ（亜種）、マガン等の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定化女沼鳥獣保護区化女沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 宮城県北部に位置し、水害防止と農業用水の補給を目的としたダムの水面部分である。ガンカモ類を始めとする渡り鳥の重要な越冬地となっており、マガンやヒシクイ（亜種）の越冬が確認されており、特にヒシクイ（亜種）は、東アジア地域個体群の個体数の１％以上を支える。
大山上池・下池（おおやまかみいけ・しもいけ）
- 所在地：
- 山形県 鶴岡市
- 登録年月日：
- 2008.10.30
- 面積（ha）：
- 39
- 湿地の特徴：
- ため池、マガモ、コハクチョウ等の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定大山上池・下池鳥獣保護区大山上池・下池特別保護地区
- 湿地の概要：
- 山形県北西部に位置し、灌漑用ため池として維持管理されている湖沼の水面部分である。ガンカモ類を始め多くの渡り鳥の全国的に重要な越冬地となっており、特に、マガモは毎年２万羽から３万羽、コハクチョウは毎年千羽から３千羽の飛来が確認されており、東アジア地域個体群の個体数の１％以上を支える。
尾瀬（おぜ）
- 所在地：
- 福島県 檜枝岐村、群馬県 片品村、新潟県 魚沼市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 8,711
- 湿地の特徴：
- 高層湿原
- 保護の形態：
- 尾瀬国立公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 東京の北方約140kmに位置。尾瀬ヶ原及び尾瀬沼を中心とする集水域の山岳、森林及び小規模な湿原で構成。尾瀬ヶ原は高層湿原を主体とする湿原としては我が国最大。トンボ類や甲虫類の多様性も高く、周囲の山岳と湿原が織りなす景観は広大で美しく、季節により様々な花が見られるなど湿原特有の動植物に恵まれた貴重な自然環境を持つ。
涸沼（ひぬま）
- 所在地：
- 茨城県 鉾田市・茨城町・大洗町
- 登録年月日：
- 2015.5.28
- 面積（ha）：
- 935
- 湿地の特徴：
- 汽水湖、カモ類の渡来地、ヒヌマイトトンボ等の生息地
- 保護の形態：
- 国指定涸沼鳥獣保護区涸沼特別保護地区
- 湿地の概要：
- 満潮時には10km下流から那珂川と涸沼川を介して海水が流れ込む天然の汽水湖である。冬期にスズガモ等水鳥が飛来する東アジア地域における重要な越冬地及び中継地となっている。
渡良瀬遊水地（わたらせゆうすいち）
- 所在地：
- 茨城県 古河市、栃木県 栃木市・小山市・野木町、群馬県 板倉町、埼玉県 加須市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 2,861
- 湿地の特徴：
- 低層湿原及び人工湿地、トネハナヤスリ、タチスミレ等の生育地、オオヨシキリ、チュウヒ等の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定渡良瀬遊水地鳥獣保護区、河川区域
- 湿地の概要：
- 関東平野のほぼ中央に位置している。周辺は、度重なる大規模な水害に見舞われてきた地域で、足尾銅山の鉱毒被害対策として、谷中村を廃村にし、遊水池がつくられた。堤防で仕切られた３つの調節池があり、本州最大級のヨシを主体とする湿地が広がっている。
奥日光の湿原（おくにっこうのしつげん）
- 所在地：
- 栃木県 日光市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 260
- 湿地の特徴：
- 高層湿原
- 保護の形態：
- 日光国立公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 栃木県の北西部に位置。戦場ヶ原、小田代原、湯ノ湖及び湯川で構成されている。戦場ヶ原は本州最大級の高層湿原である。小田代原は湿原から草原へと遷移過程にあり、湿原と草原の双方の特色を持っている。湯ノ湖は周囲３kmほどの湖で、湖底からは湯元温泉の温泉水が湧き出している。
芳ヶ平湿地群（よしがだいらしっちぐん）
- 所在地：
- 群馬県 中之条町・草津町
- 登録年月日：
- 2015.5.28
- 面積（ha）：
- 887
- 湿地の特徴：
- 火山性の特異な特徴を有する中間湿原、淡水湖、火口湖
- 保護の形態：
- 上信越高原国立公園特別地域
- 湿地の概要：
- 火山性の特異な特徴を有する湿地群（草津白根山の火山活動により形成された難透水性土壌、凹地及び火口に発達した中間湿原、淡水湖及び火口湖）で、日本固有種のモリアオガエルの最高標高の繁殖地である。
谷津干潟（やつひがた）
- 所在地：
- 千葉県 習志野市
- 登録年月日：
- 1993.6.10
- 面積（ha）：
- 40
- 湿地の特徴：
- 泥質干潟、シギ・チドリ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定谷津鳥獣保護区谷津特別保護地区
- 湿地の概要：
- 東京都心から鉄道で30分ほどの近さに位置。住宅地、高速道路に取り囲まれた東京湾に残された数少ない干潟である。全国でも有数のシギ・チドリ類の渡来地で、鳥類など身近な自然の観察地として多くの人々に親しまれている。
葛西海浜公園（かさいかいひんこうえん）
- 所在地：
- 東京都 江戸川区
- 登録年月日：
- 2018.10.18
- 面積（ha）：
- 367
- 湿地の特徴：
- 干潟、塩性湿地、カモ類の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定葛西沖三枚洲鳥獣保護区葛西沖三枚洲特別保護地区
- 湿地の概要：
- 葛西海浜公園は東京湾に流入する河川の河口に位置する汽水域である。干潮時には水深4m以浅の干潟が広がり、二枚貝類、甲殻類、多毛類など多くの生物が生息するため、カモ類をはじめとする渡り鳥の飛来地となっている。特にスズガモやカンムリカイツブリに関しては、アジア地域個体群の1％以上が飛来し、当該区域で越冬していることから、国際的にも重要な生息地になっている。
瓢湖（ひょうこ）
- 所在地：
- 新潟県 阿賀野市
- 登録年月日：
- 2008.10.30
- 面積（ha）：
- 24
- 湿地の特徴：
- ため池、コハクチョウ、オナガガモ等の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定瓢湖鳥獣保護区瓢湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 新潟平野のほぼ中央に位置し、江戸時代に灌漑用ため池として造成された瓢湖と、近年瓢湖に隣接して造成された東新池、あやめ池、さくら池から構成されている。毎年、ハクチョウ類が約６千羽渡来しており、特にコハクチョウは東アジア地域個体群の個体数の１％以上を支える。
佐潟（さかた）
- 所在地：
- 新潟県 新潟市
- 登録年月日：
- 1996.3.28
- 面積（ha）：
- 76
- 湿地の特徴：
- 大規模ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定佐潟鳥獣保護区
佐渡弥彦米山国定公園特別地域 - 湿地の概要：
- 新潟県の中央部の日本海側に位置。砂丘の形成期に砂丘間の凹部にできた湖で、地下水の湧水によって維持されている。ハクチョウ類、オオヒシクイ、マガン等の多くのガンカモ類の有数の集団渡来地である。
立山弥陀ヶ原・大日平（たてやまみだがはら・だいにちだいら）
- 所在地：
- 富山県 立山町
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 574
- 湿地の特徴：
- 雪田草原
- 保護の形態：
- 中部山岳国立公園特別保護地区
- 湿地の概要：
- 雪田草原である弥陀ヶ原・大日平、豊富な水量を誇る称名渓谷そして落差350ｍもの称名滝からなる。過去の火山活動によって形成されたなだらかな「溶岩台地」上に広がり、寒冷な気候と豪雪、豊富な水、強風の影響を受けて成立した湿地である。
片野鴨池（かたのかもいけ）
- 所在地：
- 石川県 加賀市
- 登録年月日：
- 1993.6.10
- 面積（ha）：
- 10
- 湿地の特徴：
- 大規模ガンカモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定片野鴨池鳥獣保護区片野鴨池特別保護地区
越前加賀海岸国定公園特別地域 - 湿地の概要：
- 石川県の南端、福井県との県境の加賀市西部に位置。池及び休耕田からなり、周辺は樹林帯である｡マガン､ヒシクイ､マガモ､トモエガモ等のガンカモ類が渡来するほか、オオタカ、クマタカなどの猛禽類も見られる。
中池見湿地（なかいけみしっち）
- 所在地：
- 福井県 敦賀市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 87
- 湿地の特徴：
- 低層湿原、厚く堆積した泥炭層
- 保護の形態：
- 越前加賀海岸国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 福井県敦賀市の市街地から北東部に位置し、その地形は袋状埋積谷と呼ばれる。江戸時代に湿地を新田開発した湿田地帯であり、近年まで未整備の湿田で稲作が続けられていたが、現在は湿地の保全活動を目的とした湿田以外はすべて耕作放棄されている。デンジソウやミズトラノオなどの多様な水生・湿生植物が確認されている。また、地下には約40mにおよぶ、過去約5万年の気候変動を記録した泥炭埋積物が確認されている。
三方五湖（みかたごこ）
- 所在地：
- 福井県 若狭町・美浜町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 1,110
- 湿地の特徴：
- 固有魚類生息地
- 保護の形態：
- 若狭湾国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 福井県の南西部に位置。若狭湾沿いのリアス式海岸に所在する湖の集まりであり、三方湖、水月湖、菅湖、久々子湖及び日向湖の５つの湖から成る。湖はすべてつながっているが、それぞれ塩分濃度や面積、深さが異なる。このため、５つの湖には異なる魚種が生息する。また、タモロコ、イチモンジタナゴ等の固有種の魚が生息する。
藤前干潟（ふじまえひがた）
- 所在地：
- 愛知県 名古屋市・飛島村
- 登録年月日：
- 2002.11.18
- 面積（ha）：
- 323
- 湿地の特徴：
- 河口干潟、シギ・チドリ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定藤前干潟鳥獣保護区藤前干潟特別保護地区
- 湿地の概要：
- 愛知県の西部に位置。庄内川・新川・日光川の河口を中心とする地域で、伊勢湾奥部に残された唯一の大規模な干潟。特に、シベリア等北半球の繁殖地とオセアニア等、南半球の越冬地を往復するシギ・チドリ類の中継地として重要で、国内でも最大規模のシギ・チドリ類の中継地である。
東海丘陵湧水湿地群（とうかいきゅうりょうゆうすいしっちぐん）
- 所在地：
- 愛知県 豊田市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 22.5
- 湿地の特徴：
- 非泥炭性湿地（貧栄養性湿地）、シラタマホシクサ等の生育地、ヒメタイコウチ等の生息地
- 保護の形態：
- 愛知高原国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 愛知県豊田市の矢並湿地と上高湿地、恩真寺湿地の3つの湿地からなる。矢並湿地は草本群落が優先し、上高湿地と恩真寺湿地は、草本群落とシデコブシを中心とする温帯林の両方を有する。東海地方の固有種や大陸系の種が隔離分布しているなど、特徴的な植物が15種知られ、東海丘陵要素と呼ばれている。
琵琶湖（びわこ）
- 所在地：
- 滋賀県 大津市・彦根市・長浜市・近江八幡市・草津市・守山市・野洲市・高島市・米原市・東近江市
- 登録年月日：
- 1993.6.10
- 面積（ha）：
- 65,984
- 湿地の特徴：
- 淡水湖、大規模ガンカモ渡来地、固有魚類生息地
- 保護の形態：
- 琵琶湖国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 滋賀県の中央部に位置。我が国最大の湖沼で、1,700種を超える水生動植物が報告されている。魚類はホンモロコ、ビワマス、ビワコオナマズなど17種が生息する。毎冬､コハクチョウ､ヒシクイ等10万羽を超える水鳥類が渡来する。
円山川下流域・周辺水田（まるやまがわかりゅういき・しゅうへんすいでん）
- 所在地：
- 兵庫県 豊岡市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 1,094
- 湿地の特徴：
- 河川及び周辺水田、コウノトリの生息地
- 保護の形態：
- 国指定円山川下流域鳥獣保護区円山川下流域特別保護地区、山陰海岸国立公園特別地域、河川区域
- 湿地の概要：
- 兵庫県の北東部に位置し、汽水域が河口から16㎞以上上流にまで広がる非常に緩やかな流れの円山川、その周辺水田や絶滅危惧種のコウノトリが繁殖する人工湿地「市立ハチゴロウの戸島湿地」など様々なタイプの湿地で形成されている。水田では環境創造型農業の「コウノトリ育む農法」に取り組む農家もある。2018年10月18日付で登録区域を現在の面積に拡大した。
串本沿岸海域（くしもとえんがんかいいき）
- 所在地：
- 和歌山県 串本町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 574
- 湿地の特徴：
- 非サンゴ礁域のサンゴ群集
- 保護の形態：
- 吉野熊野国立公園海域公園地区及び普通地域
- 湿地の概要：
- 和歌山県の南端部周辺のサンゴ群集が見られる海域。当該海域は黒潮の強い影響下にあり、本州中部という非サンゴ礁域に位置しながら熱帯性生物群集が豊富に見られる。特にサンゴは被度・多様性がともに高く、学術的に重要な群集が多い。
中海（なかうみ）
- 所在地：
- 鳥取県 米子市・境港市、島根県 松江市・安来市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 8,043
- 湿地の特徴：
- 大規模コハクチョウ・ホシハジロ・キンクロハジロ・スズガモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定中海鳥獣保護区中海特別保護地区
- 湿地の概要：
- 鳥取県と島根県にまたがって位置する汽水湖。面積は我が国で５番目に大きく、様々な海藻類、魚類及び貝類が生息する。我が国でも最大級のガンカモ類の越冬地であり、ハクチョウ類、シギ・チドリ類、猛禽類等の渡りの中継地及び越冬地である。
宍道湖（しんじこ）
- 所在地：
- 島根県 松江市・出雲市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 7,652
- 湿地の特徴：
- 大規模マガン・スズガモ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定宍道湖鳥獣保護区宍道湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 島根県の東部に位置する汽水湖。面積は我が国で７番目に大きく、周囲は45kmある。我が国でも最大級のガンカモ類の越冬地であるとともに、食用のヤマトシジミが多く生息することで知られ、その漁獲量は日本一である。
宮島（みやじま）
- 所在地：
- 広島県 廿日市市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 142
- 湿地の特徴：
- 砂浜海岸、塩性湿地及び河川、ミヤジマトンボの生息地
- 保護の形態：
- 瀬戸内海国立公園特別地域
- 湿地の概要：
- 瀬戸内海沿岸、広島湾の北西部に位置する宮島（嚴島）南西部の沿岸域。瀬戸内海地域でも減少しつつある自然海岸や後背の山林がよく保存されており、山間からの湧出水と大潮の時に流入する海水が混ざる潮汐湿地が形成され、国内では宮島にしか生息しないミヤジマトンボが生息できる環境が残存している。
秋吉台地下水系（あきよしだいちかすいけい）
- 所在地：
- 山口県 美祢市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 563
- 湿地の特徴：
- 地下水系・カルスト
- 保護の形態：
- 秋吉台国定公園特別地域
- 湿地の概要：
- 山口県の中西部に位置。日本では最大級のカルスト地域。地下水系は秋芳洞を始めとする多くの洞窟や洞窟内の見事な洞窟生成物を作り出している。洞窟内には特殊な洞窟性動物と地下水中で生活する水棲貝類などが多数生息している。キクガシラコウモリ、ユビナガコウモリなどコウモリは6種、2万頭以上が確認されている。
東よか干潟（ひがしよかひがた）
- 所在地：
- 佐賀県 佐賀市
- 登録年月日：
- 2015.5.28
- 面積（ha）：
- 218
- 湿地の特徴：
- 干潟、シギ・チドリ類の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定東よか干潟鳥獣保護区東よか干潟特別保護地区
- 湿地の概要：
- 有明海の北岸に位置し、河川の河口と海岸に発達する泥干潟である。湾奥部に位置するため、中央黒潮生物地理地区にありながら、黒潮（日本海流）の影響が小さく、汽水的性格が強い。秋から春にズグロカモメやクロツラヘラサギ、また、多数のシギ・チドリ類が飛来し、東アジア地域における重要な渡りの中継地及び越冬地となっている。
肥前鹿島干潟（ひぜんかしまひがた）
- 所在地：
- 佐賀県 鹿島市
- 登録年月日：
- 2015.5.28
- 面積（ha）：
- 57
- 湿地の特徴：
- 干潟、シギ・チドリ類の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定肥前鹿島干潟鳥獣保護区肥前鹿島干潟特別保護地区
- 湿地の概要：
- 佐賀県南部の有明海北西岸に位置し、河川の河口と海岸に発達する泥干潟である。湾奥部に位置するため、中央黒潮生物地理地区にありながら、黒潮（日本海流）の影響が小さく、汽水的性格が強い。秋から春にかけてズグロカモメや、チュウシャクシギ等のシギ・チドリ類が飛来し、東アジア地域における重要な渡りの中継地及び越冬地となっている。
荒尾干潟（あらおひがた）
- 所在地：
- 熊本県 荒尾市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 754
- 湿地の特徴：
- 干潟、クロツラヘラサギ、ツクシガモ等の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定荒尾干潟鳥獣保護区荒尾干潟特別保護地区
- 湿地の概要：
- 有明海の中央部東側に位置している。単一干潟としては国内でも有数の広さであり、ゴカイ類、貝類等多様な生き物が生息する豊かな環境であり、干潟を利用したノリの養殖やアサリ漁等が行われている。多くのシギ・チドリ類が、中継地及び越冬地として渡来する。
くじゅう坊ガツル ・タデ原湿原（くじゅうぼうがつる・たでわらしつげん）
- 所在地：
- 大分県 竹田市・九重町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 91
- 湿地の特徴：
- 中間湿原
- 保護の形態：
- 阿蘇くじゅう国立公園特別保護地区及び特別地域
- 湿地の概要：
- 大分県の西部に位置。タデ原及び坊ガツルの２箇所の湿原からなる。九重火山群に囲まれた盆地状の土地や山麓湧水地に形成された中間湿原である。山岳地に形成された中間湿原としては国内最大級の面積を有し、多様な地質・地形を反映した植生が分布。
出水ツルの越冬地（いずみつるのえっとうち）
- 所在地：
- 鹿児島 出水市
- 登録年月日：
- 2021.11.18
- 面積（ha）：
- 478
- 湿地の特徴：
- 水田、世界最大のナベヅル・マナヅルの越冬地
- 保護の形態：
- 国指定出水・高尾野鳥獣保護区、出水・高尾野特別保護地区、河川区域
- 湿地の概要：
- 鹿児島北西部、高尾野川、野田川、江内川の三河川が八代海に流れ込む出水扇状地の終端に広がる、河口域を干拓して造成された水田である。ナベツル及びマナヅルの世界最大の越冬地であり、ホシハジロ等のガンカモ類を含む約300種の鳥類が確認されている。
藺牟田池（いむたいけ）
- 所在地：
- 鹿児島県 薩摩川内市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 60
- 湿地の特徴：
- ベッコウトンボ生息地
- 保護の形態：
- 藺牟田池ベッコウトンボ生息地保護区管理地区
- 湿地の概要：
- 鹿児島県の北西部に位置。標高296ｍに位置する火口湖である。湖の北西部はツルヨシ、マコモ等からなる低層湿原になっており、多数の泥炭質の浮島が存在する。希少種のベッコウトンボをはじめとするトンボ類が多数見られる。
屋久島永田浜（やくしまながたはま）
- 所在地：
- 鹿児島県 屋久島町
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 10
- 湿地の特徴：
- アカウミガメ産卵地
- 保護の形態：
- 屋久島国立公園特別地域
- 湿地の概要：
- 鹿児島県の屋久島北西部に位置。当該区域は島内最長の砂浜である。砂浜は２つの部分に分けられ、永田川河口を挟んで南側に延長約１km、北側に延長約２kmの範囲となっている。アカウミガメが北太平洋で最も多く上陸し産卵する。
久米島の渓流・湿地（くめじまのけいりゅう・しっち）
- 所在地：
- 沖縄県 久米島町
- 登録年月日：
- 2008.10.30
- 面積（ha）：
- 255
- 湿地の特徴：
- 渓流及びその周辺の湿地、森林、キクザトサワヘビの生息地
- 保護の形態：
- 宇江城岳キクザトサワヘビ生息地保護区管理地区
- 湿地の概要：
- 沖縄本島の西方約100kmに位置している。久米島の宇江城岳を源流とする渓流及びその周辺の湿地、森林を中心とする地域である。日本で唯一の淡水生のヘビであるキクザトサワヘビをはじめとする希少野生生物の重要な生息地となっている。
慶良間諸島海域（けらましょとうかいいき）
- 所在地：
- 沖縄県 渡嘉敷村・座間味村
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 8,290
- 湿地の特徴：
- サンゴ礁
- 保護の形態：
- 慶良間諸島国立公園海域公園地区
- 湿地の概要：
- 日本で確認される造礁サンゴの62％の種数が生息する代表的なサンゴ礁域。海域の海中には、テーブル状、枝状、角状、塊状、被覆状等の造礁サンゴが高い密度で分布している。スズメダイ類、チョウチョウウオ類、ベラ類等のサンゴ礁特有の魚類の幼生の生育の場となっている。2015年5月28日付で登録区域を現在の面積に拡大した。
漫湖（まんこ）
- 所在地：
- 沖縄県 那覇市・豊見城市
- 登録年月日：
- 1999.5.15
- 面積（ha）：
- 58
- 湿地の特徴：
- 河口干潟、クロツラヘラサギ渡来地
- 保護の形態：
- 国指定漫湖鳥獣保護区漫湖特別保護地区
- 湿地の概要：
- 沖縄本島の南部に位置。那覇市と豊見城市の市街地の中を流れる国場川と饒波川の合流点に広がる河口湖であり、干潮時に大規模な干潟が出現する。シギ・チドリ類、カモ類、クロツラヘラサギなど渡り鳥の中継地として重要な渡来地。
与那覇湾（よなはわん）
- 所在地：
- 沖縄県 宮古島市
- 登録年月日：
- 2012.7.3
- 面積（ha）：
- 704
- 湿地の特徴：
- 干潟、 シギ・チドリ類の渡来地
- 保護の形態：
- 国指定与那覇湾鳥獣保護区与那覇湾特別保護地区
- 湿地の概要：
- 南西諸島西部にある宮古島の南西部に位置し、島内最大の干潟である。底生生物、甲殻類等が豊富なため、渡り途中のシギ・チドリ類等多くの鳥類が、採餌や休息地として飛来する。
名蔵アンパル（なぐらあんぱる）
- 所在地：
- 沖縄県 石垣市
- 登録年月日：
- 2005.11.8
- 面積（ha）：
- 157
- 湿地の特徴：
- マングローブ林、河口干潟
- 保護の形態：
- 国指定名蔵アンパル鳥獣保護区名蔵アンパル特別保護地区、西表石垣国立公園特別地域
- 湿地の概要：
- 沖縄県石垣島西部に位置。名蔵川河口部の干潟及びマングローブ林を中心とした地域。亜熱帯地域における典型的かつ多様な自然環境がまとまって存在。シギ・チドリ類などの水鳥、八重山諸島特有の猛禽類、森林性鳥類等多様な鳥類の生息地となっている。また、底生動物、甲殻類等の多様性が高い。
