植物I：レッドリスト
■準絶滅危惧（NT）
| ・ | コケシノブ科 マツバコケシダ |
| ・ | コバノイシカグマ科 ヤンバルフモトシダ |
| ・ | ミズワラビ (ホウライシダ)科 スキヤクジャク |
| ・ | イノモトソウ科 カワリバアマクサシダ |
| ・ | オシダ科 キリシマイワヘゴ、イナデンダ |
| ・ | ヤナギ科 エゾミヤマヤナギ、ミヤマヤチヤナギ |
| ・ | カバノキ科 サクラバハンノキ |
| ・ | イラクサ科 ヤエヤマラセイタソウ |
| ・ | ヤドリギ科 ニンドウバノヤドリギ |
| ・ | ツチトリモチ科 ユワンツチトリモチ |
| ・ | キンポウゲ科 ミスミソウ s.l. |
| ・ | ウマノスズクサ科 オモロカンアオイ、コシノカンアオイ、トカラカンアオイ |
| ・ | オトギリソウ科 ハコネオトギリ |
| ・ | ケシ科 チドリケマン、ナガミノツルキケマン、リシリヒナゲシ |
| ・ | アブラナ科 コイヌガラシ |
| ・ | マンサク科 アテツマンサク |
| ・ | ベンケイソウ科 ツメレンゲ、サツママンネングサ |
| ・ | ユキノシタ科 キバナハナネコノメ、ムカゴネコノメ、ヤエヤマヒメウツギ |
| ・ | バラ科 ヤクシマシロバナヘビイチゴ、リシリトウウチソウ |
| ・ | マメ科 ボウコツルマメ、ワニグチモダマ |
| ・ | フウロソウ科 ヤクシマフウロ |
| ・ | キントラノオ科 コウシュンカズラ |
| ・ | ホルトノキ科 ナガバコバンモチ |
| ・ | ジンチョウゲ科 シャクナンガンピ |
| ・ | グミ科 ヤクシマグミ |
| ・ | スミレ科 タカネスミレ |
| ・ | シュウカイドウ科 マルヤマシュウカイドウ |
| ・ | ミソハギ科 ヤクシマサルスベリ |
| ・ | ハマザクロ科 マヤプシギ |
| ・ | アリノトウグサ科 タチモ |
| ・ | ミズキ科 リュウキュウハナイカダ |
| ・ | セリ科 ムニンハマウド、ツシマノダケ |
| ・ | イワウメ科 シマイワウチワ |
| ・ | イチヤクソウ科 オオウメガサソウ |
| ・ | ツツジ科 ヤクシマミツバツツジ |
| ・ | サクラソウ科 シマギンレイカ |
| ・ | カキノキ科 ヤエヤマコクタン |
| ・ | ハイノキ科 コニシハイノキ |
| ・ | モクセイ科 ヤマトレンギョウ |
| ・ | リンドウ科 ヨコヤマリンドウ、チシマリンドウ、シロウマリンドウ、ハナヤマツルリンドウ、ヤクシマツルリンドウ |
| ・ | キョウチクトウ科 ホソバヤロード |
| ・ | ガガイモ科 ケナシツルモウリンカ |
| ・ | アカネ科 シマザクラ、ニコゲルリミノキ、シチョウゲ、オオイナモリ |
| ・ | ヒルガオ科 マルバアサガオカラクサ |
| ・ | クマツヅラ科 ヤエヤマハマゴウ |
| ・ | シソ科 タチキランソウ、コケトウバナ、ミゾコウジュ、ヤクシマシソバタツナミ、ムニンタツナミソウ |
| ・ | ゴマノハグサ科 カワヂシャ |
| ・ | スイカズラ科 チョウジガマズミ |
| ・ | キク科 オオナガバハグマ、ヒロハヤマヨモギ、ヒメキクタビラコ、ヤマザトタンポポ、オダサムタンポポ |
| ・ | オモダカ科 アギナシ |
| ・ | ユリ科 アマミラッキョウ、ヤクシマシライトソウ、ヒメカカラ、タカクマホトトギス |
| ・ | アヤメ科 ヒメシャガ |
| ・ | イグサ科 タカネイ、クモマスズメノヒエ、コゴメヌカボシ |
| ・ | ホシクサ科 スイシャホシクサ |
| ・ | イネ科 ヒメコヌカグサ、タイワンアシカキ、オガサワラススキ |
| ・ | ヤシ科 オガサワラビロウ、ヤエヤマヤシ |
| ・ | ミクリ科 ミクリ、ナガエミクリ |
| ・ | カヤツリグサ科 タカネヤガミスゲ、シマタヌキラン、チャイロスゲ、オキナワヒメナキリ、サコスゲ、ヒロハオゼヌマスゲ |
| ・ | ラン科 シラン、トクサラン、ユウレイラン、シラヒゲムヨウラン、オキナワムヨウラン、シマササバラン、ボウラン、ヤクシマトンボ、イシガキキヌラン |