On peut penser que la forêt humide subtropicale s’étendait sur un vaste territoire à l’époque où les îles d’Ogasawara étaient inhabitées. Mais elle a régressé du fait du développement et, aujourd’hui, on ne la trouve plus que dans certains environnements humides de l’île de Hahajima. Cette forêt est constituée de grands arbres, dont la hauteur peut aller jusqu’à 20 m, avec une canopée composée de plantes telles que Elaeocarpus photiniaefolius ou Planchonella obovata. On peut également trouver le Morus boninensis, arbre qui est devenu une espèce rare du fait de l’exploitation en tant que bois de construction.