国土交通省，国土数値情報（行政区域データ）.
【藻場・海草藻場】
環境省. 第4回自然環境保全基礎調査 海域生物環境調査（第2巻藻場）.
環境省. 第5回自然環境保全基礎調査 海域自然環境保全基礎調査 重要沿岸域生物調査（海辺調査）
【サンゴ／サンゴ礁】
環境省. 第4回自然環境保全基礎調査 海域生物環境調査（第3巻サンゴ礁）.
環境省. 第5回自然環境保全基礎調査 海域自然環境保全基礎調査 重要沿岸域生物調査（海辺調査）
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【干潟】
環境省. 第4回自然環境保全基礎調査 海域生物環境調査（第1巻干潟）.
環境省. 第5回自然環境保全基礎調査 海域自然環境保全基礎調査 重要沿岸域生物調査（海辺調査）
【砂堆位置情報】
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【マングローブ】
環境省. 第5回自然環境保全基礎調査（海辺調査）.
【カキ礁】
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【自然海岸（海岸線情報）】
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環境省. 第6回自然環境保全基礎調査，植生調査（平成16年）.（植生自然度）
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国土数値情報（道路密度・道路延長メッシュデータ）国土交通省（道路延長解析）
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【魚類】
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IUNC Red List: IUCN. 2012. The IUCN Red List of Threatened Species. (http://www.iucnredlist.org/)
OBIS、GBIFデータ（※）
【十脚目（甲殻類）等】
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日本ベントス学会編. 2012. 干潟の絶滅危惧動物図鑑―海岸ベントスのレッドデータブック―. 285pp.
駒井智幸氏（千葉県立中央博物館）提供資料（固有種リスト、分布情報）.
清野聡子氏（九州大学大学院工学研究院 環境社会部門 生態工学研究室）提供資料（カブトガニ）.
OBIS、GBIFデータ（※）
【ウミグモ類】
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環境省. 第7回自然環境保全基礎調査 浅海域生態系調査（藻場調査）.
環境省. 第４次レッドリスト: http://www.biodic.go.jp/rdb/rdb_f.html
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Nakamura K, Child CA. (1983) Shallow-water Pycnogonida from the Izu Peninsura, Japan. Smithsonian Contributions to Zoology 386:1-71
OBIS、GBIFデータ（※）
【爬虫類（ウミガメ類、ウミヘビ類】
環境省. 第6回自然環境保全基礎調査（種の多様性調査）.
環境省. 自然環境保全基礎調査 海域生態系調査（ウミガメ調査）報告書.
環境省. 第４次レッドリスト: http://www.biodic.go.jp/rdb/rdb_f.html
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【刺胞動物類（イシサンゴ類、八放サンゴ類、宝石サンゴ類、ソギンチャク類】
環境省. 第5回自然環境保全基礎調査 海域自然環境保全基礎調査 （重要沿岸域生物調査）.
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OBIS、GBIFデータ（※）
【軟体動物類（腹足類、二枚貝類、頭足類）】
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石井実、郷右近勝夫、矢田脩編. 2002. 昆虫類の多様性保護のための重要地域 第3集. 日本昆虫学会自然保護委員会110pp.
【植物（植生自然度、アマモ類、塩生湿地植物類）】
環境省. 第6回、第7回自然環境保全基礎調査（植生調査）.
環境省. 第7回自然環境保全基礎調査 浅海域生態系調査（藻場調査）.
環境省. 第４次レッドリスト: http://www.biodic.go.jp/rdb/rdb_f.html
【その他無脊椎動物（多毛類（環形動物類）など）】
環境省. 第7回自然環境保全基礎調査 浅海域生態系調査（干潟調査）.
環境省. 第４次レッドリスト: http://www.biodic.go.jp/rdb/rdb_f.html
日本ベントス学会編. 2012. 干潟の絶滅危惧動物図鑑―海岸ベントスのレッドデータブック―. 285pp.
※OBIS (Ocean Biogeographic Information System): OBIS. 2012. Data from the Ocean Biogeographic Information System. Intergovernmental Oceanographic Commission of UNESCO. (http://www.iobis.org.)
※GBIF (The Global Biodiversity Information Facility )data portal. (www.gbif.org/)
天然記念物：文化庁，国指定文化財データベース （http://kunishitei.bunka.go.jp/bsys/index_pc.asp）
Marin IBA：バードライフ・インターナショナル. 2012. Marine e-atlas. http://54.247.127.44/marineIBAs/