既存資料調査、現地調査及びアンケート調査により、イヌワシでは全国で６３５メッシュ（１０km×１０km）、クマタカでは全国で１，４０２メッシュ（１０km×１０km）において生息が確認された（別紙１・２参照）。生息が確認されていないメッシュには、まだ調査が行われていないメッシュが含まれているため、今後の調査の進展によって、新たな生息が確認される可能性がある。
　なお、イヌワシ生息分布図は、これまでにも作成されているが、実際に生息が確認された地点だけでなく、アンケート調査等により生息が推定される地点の外周を線で囲んだものであった。今回の生息分布図は、実際に生息が確認された地点または生息の可能性が高い地点を１０kmメッシュにプロットしたものであり、より正確で詳細な情報となっている。

　イヌワシでは、既存資料調査、現地調査及びアンケート調査より、最低でも約２００ペアが確認されたことから、全国での最小推定個体数は、２００ペア×２羽＝約４００羽となっている。
　全国でのイヌワシの推定個体数は、以下の式で求められる。
　（推定個体数）＝（ペアとなっている個体の数）÷（１−（単独個体の割合））
　アンケート調査からさらに約６０ペアの生息が推定されており、海外の文献よりペアを形成していない単独個体（幼鳥や若鳥を含む。）の個体数を全個体数の２０％と仮定すると、全国での推定個体数は、（２００ペア＋６０ペア）×２羽÷（１−０．２）＝約６５０羽と推測される。
　クマタカでは、既存資料調査、現地調査及びアンケート調査より、最低でも約９００ペアが確認されたことから、全国での最小推定個体数は、９００ペア×２羽＝約１，８００羽となっている。
　全国でのクマタカの個体数の推定については、クマタカはイヌワシと比べて分布域が広く、精度の高い推定を行い得る基礎的な分布データが十分に集積されているとはいえないため、今回は行っていない。
　今回の個体数の推定値が、これまでの推定値（イヌワシでは４００〜５００羽、クマタカでは９００〜１０００羽）より大きくなっているが、これは、以前より調査が進展し、今まで調査が実施されていなかった地域で新たな生息が確認されたためであり、両種の個体数が増加しているということではない。
　イヌワシ・クマタカの繁殖成功率は全国的に低下傾向にあるため、将来における個体数の急激な減少が危惧されている。

　別表参照